Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms