Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms