Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBQ06643 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms