Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms