Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms