Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms