Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms