Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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