Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms