Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms