Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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