Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms