Protein–RNA interactions for Protein: P55957

BID, BH3-interacting domain death agonist, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIDP55957 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIDP55957 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIDP55957 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms