Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms