Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms