Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms