Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms