Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA3P42263 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms