Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDIT3P35638 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms