Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms