Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms