Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms