Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms