Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms