Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms