Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCL3P20749 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCL3P20749 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms