Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DESP17661 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DESP17661 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms