Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTRB1P17538 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTRB1P17538 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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