Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms