Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBTFP17480 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBTFP17480 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms