Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms