Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRF1P14222 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms