Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms