Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRP12270 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRP12270 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRP12270 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms