Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms