Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEFHP12036 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEFHP12036 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEFHP12036 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms