Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms