Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SBK2P0C263 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms