Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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