Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms