Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms