Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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