Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS6O14544 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS6O14544 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms