Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms