Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms