Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM3A6NNA2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM3A6NNA2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms