Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms