Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS37CA5D8V6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS37CA5D8V6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms