Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
A4D1N5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
A4D1N5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
A4D1N5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
A4D1N5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
A4D1N5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
A4D1N5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms