Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC162PA2VCL2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms